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H2020 program / Horizon Europe

MALDIBANK

Arquivo aberto de espectros MALDI de multi-domínios para identificação de microrganismos

Investigador principal

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Investigador

Alexandre Campos licenciou-se em Biologia (1996) pela Universidade de Aveiro e possui mestrado em Melhoramento de Plantas (1999) pela Universidade de Évora. Concluiu o doutoramento em Ciências Biológicas em 2005 no Instituto de Tecnologia Química e Biológica (ITQB) da Universidade Nova de Lisboa. Atualmente é Investigador Auxiliar no CIIMAR (Laboratório de Biotecnologia Azul, Ambiente e Saúde) e os seus principais interesses de investigação incluem a toxicologia e avaliação de risco da proliferação de algas nocivas. O investigador está particularmente interessado no metabolismo de biotoxinas em moluscos bivalves, avaliação da qualidade da água e reutilização de água na agricultura.

EQUIPAS DE INVESTIGAÇÃO:
Biotecnologia azul, saúde e ambiente

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MALDIBANK: Uma solução abrangente para os desafios microbianos.

Numa época marcada por desafios ambientais e de saúde prementes, incluindo as alterações climáticas, a perda de biodiversidade, as epidemias globais e a segurança alimentar, é fundamental compreender e tirar partido do poder dos micróbios. Os micróbios, fundamentais para a biosfera, têm impacto em tudo, desde a dinâmica dos ecossistemas à saúde humana. No entanto, a sua vasta diversidade continua a ser largamente subestimada. Para aproveitar este potencial, a identificação precisa dos microrganismos é crucial, especialmente tendo em conta as suas variadas implicações em diferentes sectores. Nos últimos 15 anos, a espetrometria de massa (MS) MALDI-TOF (Matrix-Assisted Laser Desorption/ Ionization Time-of-Flight) revolucionou a identificação microbiana em domínios como a microbiologia clínica, a segurança alimentar, a monitorização ambiental e a agricultura sustentável. Apesar do seu potencial transformador, a tecnologia MALDI-TOF MS tem sido subutilizada fora da microbiologia clínica. O MALDIBANK surge como uma iniciativa inovadora para alargar o alcance desta tecnologia, fornecendo soluções inovadoras para compreender e utilizar a diversidade microbiana para a resolução de problemas globais. O MALDIBANK é concebido como um banco de dados de espectros MALDI global, baseado na nuvem e aberto para a identificação de microrganismos, combinando uma vasta base de dados de espectros com ferramentas algorítmicas avançadas. Este banco de dados facilitará o processamento, a caraterização, a vigilância epidemiológica e muito mais, incorporando os princípios da Ciência Aberta e dos dados FAIR. O seu objetivo é tornar-se uma nova referência na identificação microbiana, estabelecendo paralelos com o impacto do GenBank na genómica. Ao integrar 100 000 espectros de referência com metadados ricos e ao empregar modelos de aprendizagem profunda, o MALDIBANK irá melhorar a caraterização microbiana e apoiar áreas como a previsão da resistência antimicrobiana e a monitorização ambiental. Servirá como um recurso dinâmico para a comunidade científica mundial, permitindo a exploração das capacidades microbianas.

Instituição líder
CIIMAR-UP
Programa
Horizon Europe
Financiamento
Outros projectos