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Equipa de investigação

Genética e Evolução Animal

Biologia, Aquacultura e Qualidade dos Produtos do Mar

Uma questão central na Biologia Evolutiva é a forma como as diferenças no repertório genético afetam a diversidade morfológica e fisiológica das espécies animais. Para abordar esta questão, temos de considerar aspetos como o número de genes, a atribuição ortológica, os padrões de perda de genes, a contribuição da duplicação de genes e a interação destes eventos genómicos com as condições ambientais (adaptação). O objetivo central a longo prazo da equipa de Genética e Evolução Animal (AGE) é elucidar e compreender a evolução de características complexas e redes de genes em Metazoários e o seu impacto na fisiologia animal, em particular no contexto da Época Antropocénica.

A Era das “Ómicas”, exemplificada pelo número extraordinário de projetos de genomas completos atualmente disponíveis, oferece uma oportunidade única e oportuna para investigar e compreender a base da diversidade fisiológica animal. A equipa tem investigado o impacto das trajetórias da história de vida no contexto dos processos genómicos que afetam o repertório genético (perda e duplicação de genes). Através da combinação de genómica comparativa e funcional, estamos a realizar uma extensa caracterização do repertório de genes biossintéticos de ácidos gordos (dessaturases e elongases) e recetores nucleares em espécies representativas de filos chave informativos (e.g., esponjas, briozoários, anelídeos, moluscos, cefalocordados e vertebrados) para abordar a evolução da fisiologia lipídica e da função endócrina em Metazoários, especialmente no contexto do Antropoceno.

Investigador principal

Líder de equipa

Filipe Castro é Professor Auxiliar na Faculdade de Ciências da Universidade do Porto e PI da equipa em Genética Animal e Evolução. Entre os vários focus de investigação do grupo estão a Genómica Comparada, Fisiologia e Evolução, Bioinformática e o Antropoceno.

EQUIPAS DE INVESTIGAÇÃO:
Genética e Evolução Animal
Co-investigador principal
Investigador

Mónica Lopes-Marques tem duas licenciaturas, Biologia/Geologia (2005), e Genética/Biotecnologia (2008), ela igualmente detém o grau de mestrado em Genética Comparativa (2011). Em 2017, concluiu o Doutoramento em Ciências Biomédicas (2017). Ela já participou em vários projetos internacionais e tem experiência na gestão de projetos e dados para a EU.
Atualmente a Mónica é Investigadora FCT no CIIMAR (2022.00397.CEECIND), e a sua investigação tem como foco os Mamíferos aquáticos e as suas adaptações metabólicas. Ela pretende entender a correlação entre evolução molecular e adaptação fenotípica e usar esse conhecimento para avaliar o verdadeiro impacto de fatores ambientais em mamíferos aquáticos.

EQUIPAS DE INVESTIGAÇÃO:
Genética e Evolução Animal
Projetos de investigação

ADAPTCHANGE

ATLANTIDA

BLUEandGREEN

CanAdapt

CORAL

DEEPRISK

E-IMUNO

EvoDis

INNOVMAR

MarInfo

NIAF

Ocean3R

SIDESTREAM

TRANSobesogen

Membros da equipa

Bolsa de investigação
EQUIPAS DE INVESTIGAÇÃO:
Genética e Evolução Animal
Ecologia e Evolução Aquática
Estudante de Mestrado

O meu nome é Bernardo Pinto e estou de momento a completar o Mestrado em Biodiversidade, Genética e Evolução pela Faculdade de Ciências da Universidade do Porto. A minha tese, intitulada “The Recurrent Evolution of Aglomerular Kidneys in Teleosts” estuda as bases genéticas para a aglomerularidade em peixes teleósteos. As minhas principais áreas de interesse são Genética, Evolução, Etologia e Paleogenómica.

EQUIPAS DE INVESTIGAÇÃO:
Genética e Evolução Animal
PhD Student
EQUIPAS DE INVESTIGAÇÃO:
Genética e Evolução Animal
PhD student
Human Resources

Diogo Oliveira completou o seu mestrado em bioquímica em 2017, na Universidade do Porto, cuja dissertação teve como foco central a evolução do metabolismo de cobalamina em vertebrados. Atualmente, é estudante de doutoramento no CIIMAR, estudando a evolução do metabolismo de xenobióticos em cetáceos.

Genética e Evolução Animal
Disruptores Endócrinos e Contaminantes Emergentes
Técnico de Investigação

Elza Fonseca é Investigadora do CIIMAR. É licenciada em Bioquímica (2010) e mestre em Bioengenharia (2013) pela Universidade do Minho, e doutorada em Biologia (2020) pela Faculdade de Ciências da Universidade do Porto. A sua investigação foca-se essencialmente no estudo de receptores nucleares como uma das maiores superfamílias de fatores de transcrição exclusivos dos metazoários e responsáveis pela regulação de processos biológicos como diferenciação celular, desenvolvimento, metabolismo e reprodução, tendo por base a Biologia Molecular e Celular, Genómica Comparativa e Funcional e Biologia Evolutiva.

EQUIPAS DE INVESTIGAÇÃO:
Genética e Evolução Animal
Ecologia e Evolução Aquática
Investigador

J. Miguel Cordeiro (PhD) has obtained his Licence in Biology (Aveiro (PT)) in 1998; he then took a Master’s degree in Cell Biology (Coimbra (PT)) in 2004 and a PhD in Biology (Aveiro (PT) / Genève (CH)) in 2008. He is now a researcher at CIIMAR in the field of neurobiology dedicated at studying new regulatory mechanisms of fast neurosecretion and on discovering new bioactive compounds effective against several neurological diseases tested in pre-clinical models (Torpedo marmorata and Danio rerio) of disease (Epilepsy, Parkinson’s; Alzheimer’s and Neuromuscular diseases).

EQUIPAS DE INVESTIGAÇÃO:
Genética e Evolução Animal
Investigador

I am the group leader of the Molecular Physiology Lab and have been an Associate Professor at Wilfrid Laurier University (Canada) since 2014. I obtained my PhD from the University of British Columbia (Canada) in 1999. I am pursuing a line of research in fish physiology focused primarily on elucidating the mechanisms of ion and nitrogen regulation. However, my research has expanded into understanding the story of stomach loss in vertebrates. My research has been funded by NSERC (Canada) and FCT (Portugal).

EQUIPAS DE INVESTIGAÇÃO:
Genética e Evolução Animal
Bolsa de investigação

Luís Q. Alves has completed his bachelor's degree in Biology in 2017 (University of Porto – Faculty of Sciences) and master's degree in Bioinformatics and Computational Biology in 2019 (University of Porto – Faculty of Sciences). Since that, he has been working as Research Fellow / Bioinformatician at the Interdisciplinary Centre of Marine and Environmental Research (CIIMAR – University of Porto). Luís uses and develops computational solutions to study large-scale genomic data, as well as to explore diverse evolutionary processes, namely the mechanism of evolution by gene loss.  

EQUIPAS DE INVESTIGAÇÃO:
Genética e Evolução Animal
Investigador

I am a postdoctoral researcher at CIIMAR. I am a biologist, and hold my M.Sc. in Marine Science and Resources, Aquaculture and Fisheries at the University of Porto (2012) and my Ph.D. in Aquaculture at the University of Vigo (2016). During my Ph.D., my studies were oriented toward the diversification of species of interest for aquaculture. I am currently applying genetic tools to explain key aspects of the feeding strategy and diet composition in fish and cephalopods in aquaculture.

EQUIPAS DE INVESTIGAÇÃO:
Genética e Evolução Animal
Investigador

Mónica Lopes-Marques tem duas licenciaturas, Biologia/Geologia (2005), e Genética/Biotecnologia (2008), ela igualmente detém o grau de mestrado em Genética Comparativa (2011). Em 2017, concluiu o Doutoramento em Ciências Biomédicas (2017). Ela já participou em vários projetos internacionais e tem experiência na gestão de projetos e dados para a EU.
Atualmente a Mónica é Investigadora FCT no CIIMAR (2022.00397.CEECIND), e a sua investigação tem como foco os Mamíferos aquáticos e as suas adaptações metabólicas. Ela pretende entender a correlação entre evolução molecular e adaptação fenotípica e usar esse conhecimento para avaliar o verdadeiro impacto de fatores ambientais em mamíferos aquáticos.

EQUIPAS DE INVESTIGAÇÃO:
Genética e Evolução Animal
Estudante de Mestrado

O meu nome é Nádia Silva e licenciei-me em Biologia pela Faculdade de Ciências da Universidade do Porto (FCUP). Atualmente, estou a fazer o mestrado em Ciências do Mar – Recursos Marinhos no ICBAS, e estou a trabalhar na tese no grupo de Genética e Evolução Animal (AGE). Os meus principais interesses são a genética, evolução, ecologia e conservação.

EQUIPAS DE INVESTIGAÇÃO:
Genética e Evolução Animal
Estudante de Mestrado
Human Resources

Nuno de Sousa nasceu em 2000 na cidade de Lousada, Porto. Licenciou-se em Biologia pela Faculdade de Ciências da Universidade do Porto (FCUP). Neste momento encontra-se a realizar mestrado em Biologia Celular e Molecular pela FCUP, estando a realizar trabalho de tese no grupo de Genética Animal e Evolução (AGE). Os seus principais interesses são a genética, evolução, filogenética e taxonomia.

Genética e Evolução Animal
PhD Student

Rui Pinto obteve a licenciatura em Biologia em 2016 e o mestrado em Biodiversidade, Genética e Evolução em 2018 pela Universidade do Porto. Em 2020, foi-lhe atribuída uma bolsa mista de doutoramento da FCT para realizar genómica comparativa em grande escala com o objetivo de compreender as bases moleculares das especializações dietéticas aviárias. O trabalho será desenvolvido entre o CIIMAR e o Centro de Macroecologia, Evolução e Clima (Universidade de Copenhaga). Ele está interessado na interação entre genética, evolução e ecologia.

EQUIPAS DE INVESTIGAÇÃO:
Genética e Evolução Animal
Investigador
Human Resources

Eu sou um biólogo evolutivo principalmente focado no estudo de questões evolutivas como a adaptação e a especiação usando ferramentas genómicas, particularmente interessado em compreender o papel dos rearranjos cromossómicos na adaptação e isolamento reprodutivo em espécies do género Littorina (Gastrópode marinho). O meu principal objetivo é contribuir para um ambiente de investigação criativo na procura de respostas para diversas questões no campo da biologia evolutiva. Atualmente sou investigador no CIBIO/InBIO (Universidade do Porto), mantendo uma estreita colaboração com investigadores no CIIMAR (também da Universidade do Porto), assim como na Universidade de Sheffield (Reino Unido).

Genética e Evolução Animal
Investigador

Ester Dias é bióloga e mestre em Ecologia Aplicada (2007) e doutorda em Ciências do Ambiente e do Mar (2014), concluído na Universidade do Porto. Atualmente é investigadora de pós-doutoramento no CIIMAR onde estuda a plasticidade da história de vida de espécies diádromas. Os seus interesses de investigação também incluem ecologia estuarina e invasões biológicas, e a utilização de marcadores ecológicos (por exemplo, isótopos estáveis) para caracterizar cadeias alimentares e movimentos de peixes.

EQUIPAS DE INVESTIGAÇÃO:
Ecologia Fluvial e Costeira
Genética e Evolução Animal

Principais publicações

LXRα and LXRβ Nuclear Receptors Evolved in the Common Ancestor of Gnathostomes.

Fonseca E., Ruivo R., Lopes-Marques M., Zhang H., Santos M.M., Venkatesh B., Castro L.F.

2017Genome Biology and Evolution, 9(1):222-230
A mollusk VDR/PXR/CAR-like (NR1J) nuclear receptor provides insight into ancient detoxification mechanisms

Cruzeiro C., Lopes-Marques M., Ruivo R., Rodrigues-Oliveira N., Santos M.M., Rocha M.J., Rocha E., Castro L.F.

2016Aquatic Toxicology, 174: 61-9
Evolutionary functional elaboration of the Elovl2/5 gene family in chordates

Monroig Ó., Lopes-Marques M., Navarro J.C., Hontoria F., Ruivo R., Santos M.M., Venkatesh B., Tocher D.R., Castro L.F.

2016. Scientific Reports, 6: 20510.
To bind or not to bind: the taxonomic scope of nuclear receptor mediated endocrine disruption in invertebrate phyla

Castro L.F.C., Santos M.M.

2014Environmental Science and Technology, 48(10): 5361-5363