Genómica é o estudo dos genomas dos organismos. O seu principal objetivo é determinar a sequência parcial ou total do DNA por meio da amplificação de um único gene através da Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) ou através do sequenciamento de genes em larga escala por Sequenciamento de Próxima Geração (NGS).

Como o produto final de um gene é muitas vezes uma proteína, o conhecimento da sequência do DNA tornou-se de vital importância na medicina e na biotecnologia, desvendando as bases de algumas doenças através de mutações específicas. Além disso, a genómica evolutiva, que combinou trabalho experimental e ferramentas de bioinformática, é atualmente uma parte importante da investigação biológica no campo da genómica, permitindo a reconstrução filogenética de famílias de genes, fornecendo informações sobre a história natural da vida.
A proteómica, juntamente com a genómica, é hoje em dia uma ferramenta de investigação indispensável nas ciências Biológicas e Ambientais. A evolução da tecnologia, nomeadamente ao nível da espectrometria de massa, está a permitir hoje em dia o acesso a informação quantitativa de centenas de proteínas, que tem sido utilizada para interpretar respostas metabólicas e fisiológicas relevantes nos organismos, que os métodos bioquímicos convencionais não conseguem fornecer. O CIIMAR tem utilizado diversas estratégias proteómicas na área da toxicologia, nomeadamente para compreender e caracterizar o modo de ação dos contaminantes ambientais nos organismos aquáticos. Além disso, a proteómica tem sido utilizada para identificar e caracterizar propriedades metabólicas e fisiológicas únicas de invertebrados marinhos. Concretamente o CIIMAR tem experiência e disponibiliza à comunidade científica as seguintes análises proteómicas: SDS-PAGE; -DE; Blue-native PAGE; proteómica quantitativa label-free; proteómica shotgun.
Até à data, o aumento contínuo de sequências de organismos não-modelo em bases de dados públicas (genomas completos, transcriptomas e proteomas), impulsionou estudos proteogenómicos aprofundados, descrevendo milhares de novos genes e proteínas, fornecendo informações sobre processos complexos em diversas vias metabólicas.